അദ്ദേഹം ആരംഭിച്ച തോഴിലാളി (തൊഴിലാളി) വാരിക പിന്നീട് ദിനപത്രമായി വളർന്നു. 1958ൽ ആദ്യത്തെ കമ്മ്യൂണിസ്റ്റ് മന്ത്രിസഭയ്‌ക്കെതിരെ വിമോചന സമരം എന്ന പ്രക്ഷോഭം പൊട്ടിപ്പുറപ്പെട്ടപ്പോൾ വടക്കൻ നേതൃത്വപരമായ പങ്ക് വഹിച്ചു. ആ സമരം ഏകോപിപ്പിച്ച ജനറൽ സെക്രട്ടറിമാരിൽ ഒരാളായിരുന്നു ഫാദർ വടക്കൻ. കമ്മ്യൂണിസ്റ്റ് വിരുദ്ധ മുന്നണി (എസിഎഫ്) എന്ന പ്രസ്ഥാനത്തിന് അദ്ദേഹം തുടക്കമിട്ടു. എന്നാൽ, എ.കെ.ഗോപാലനെപ്പോലുള്ള കമ്മ്യൂണിസ്റ്റുകാരുമായി മറ്റ് ചില പ്രക്ഷോഭങ്ങളിൽ അദ്ദേഹം സഖ്യമുണ്ടാക്കി. പിന്നീട് അദ്ദേഹം കേരളത്തിലെ കുടിയേറ്റ കർഷകരുടെ ആവശ്യത്തിനായി സമരങ്ങൾ സംഘടിപ്പിക്കുകയും ബി. വെല്ലിംഗ്ടൺ പ്രസിഡന്റായി കെടിപി സ്ഥാപിക്കുകയും ചെയ്തു. കർഷകരുടെയും തൊഴിലാളികളുടെയും ദുരിതം ഉയർത്തിക്കാട്ടുന്നതിനായി "മലയോരശബ്ദം" (മലകളിൽ നിന്നുള്ള ശബ്ദം), "കേരള ടെമ്പസ്റ്റ്" തുടങ്ങിയ പ്രസിദ്ധീകരണങ്ങളും അദ്ദേഹം ആരംഭിച്ചിരുന്നു.

വടക്കന്റെ പാരമ്പര്യേതര വഴികൾ അദ്ദേഹത്തെ സഭയുമായി വൈരുദ്ധ്യത്തിലേക്ക് നയിച്ചു. കമ്മ്യൂണിസ്റ്റുകാരുമായുള്ള അദ്ദേഹത്തിന്റെ കൂട്ടുകെട്ട് സഭയ്ക്ക് ഇഷ്ടപ്പെട്ടില്ല. 1971-ൽ ഫാദർ വടക്കൻ തന്റെ ബിഷപ്പിനെ ധിക്കരിക്കുകയും തൃശ്ശൂരിലെ തേക്കിൻകാട് മൈതാനിയിൽ പൊതു വിശുദ്ധ കുർബാന നടത്തുകയും ചെയ്തത് വിവാദങ്ങൾക്ക് കാരണമായി. കുർബാനയിൽ നിന്ന് 8 വർഷത്തേക്ക് സസ്‌പെൻഡ് ചെയ്യപ്പെട്ടെങ്കിലും വൈദികനായി തുടർന്നു. എന്നാൽ മൂന്ന് വർഷത്തിന് ശേഷം രൂപത സസ്പെൻഷൻ പിൻവലിച്ചു.[3]

ഫാ. വടക്കൻ അമ്പതോളം പുസ്തകങ്ങൾ രചിക്കുകയും കവിതാ സമാഹാരങ്ങളും നാടകങ്ങളും പുറത്തിറക്കുകയും ചെയ്തു. "എന്റെ കുതിപ്പും കിതപ്പും" എന്ന തന്റെ പ്രസിദ്ധമായ ആത്മകഥയും അദ്ദേഹം എഴുതിയിട്ടുണ്ട്.[4]അദ്ദേഹം ആരംഭിച്ച തോഴിലാളി (തൊഴിലാളി) വാരിക പിന്നീട് ദിനപത്രമായി വളർന്നു. 1958ൽ ആദ്യത്തെ കമ്മ്യൂണിസ്റ്റ് മന്ത്രിസഭയ്‌ക്കെതിരെ വിമോചന സമരം എന്ന പ്രക്ഷോഭം പൊട്ടിപ്പുറപ്പെട്ടപ്പോൾ വടക്കൻ നേതൃത്വപരമായ പങ്ക് വഹിച്ചു. ആ സമരം ഏകോപിപ്പിച്ച ജനറൽ സെക്രട്ടറിമാരിൽ ഒരാളായിരുന്നു ഫാദർ വടക്കൻ. കമ്മ്യൂണിസ്റ്റ് വിരുദ്ധ മുന്നണി (എസിഎഫ്) എന്ന പ്രസ്ഥാനത്തിന് അദ്ദേഹം തുടക്കമിട്ടു. എന്നാൽ, എ.കെ.ഗോപാലനെപ്പോലുള്ള കമ്മ്യൂണിസ്റ്റുകാരുമായി മറ്റ് ചില പ്രക്ഷോഭങ്ങളിൽ അദ്ദേഹം സഖ്യമുണ്ടാക്കി. പിന്നീട് അദ്ദേഹം കേരളത്തിലെ കുടിയേറ്റ കർഷകരുടെ ആവശ്യത്തിനായി സമരങ്ങൾ സംഘടിപ്പിക്കുകയും ബി. വെല്ലിംഗ്ടൺ പ്രസിഡന്റായി കെടിപി സ്ഥാപിക്കുകയും ചെയ്തു. കർഷകരുടെയും തൊഴിലാളികളുടെയും ദുരിതം ഉയർത്തിക്കാട്ടുന്നതിനായി "മലയോരശബ്ദം" (മലകളിൽ നിന്നുള്ള ശബ്ദം), "കേരള ടെമ്പസ്റ്റ്" തുടങ്ങിയ പ്രസിദ്ധീകരണങ്ങളും അദ്ദേഹം ആരംഭിച്ചിരുന്നു.

Thozhilali (Worker's) weekly which he started later grew into a daily newspaper. In 1958, the North played a leading role in the liberation struggle against the first communist government. Father Vadkan was one of the general secretaries who coordinated that strike. He started the Anti-Communist Front (ACF) movement. However, he allied himself with communists like AK Gopalan in some other agitations. Later he organized struggles for the needs of migrant farmers in Kerala and B. KTP was established with Wellington as its president. He also started publications like "Malayorashabdam" (Voice from the Hills) and "Kerala Tempest" to highlight the plight of farmers and labourers.